CDNA: n ja genomisen DNA: n välinen ero - Ero-Välillä

CDNA: n ja genomisen DNA: n välinen ero

Tärkein ero - cDNA vs. genomi-DNA

Täydentävä DNA (cDNA) ja genomi-DNA ovat kahden tyyppisiä DNA-molekyylejä, joita käytetään molekyylibiologian tutkimuskokeissa. Sekä cDNA että genominen DNA koostuvat DNA-nukleotideista. cDNA tuotetaan käänteisellä transkriptiolla uutetusta RNA: sta kudoksesta. Käänteistranskriptiossa käytettävät RNA-tyypit voivat olla kokonais-RNA, pre-mRNA, RNA, ribosomaalinen RNA tai tRNA. Genominen DNA voidaan kuitenkin eristää suoraan solusta. tärkein ero cDNA: n ja genomisen DNA: n välillä on se cDNA edustaa tietyn organismin transkriptiota, kun taas genominen DNA edustaa genomia.

Avainalueet katettu

1. Mikä on cDNA
- Määritelmä, tosiasiat, rooli
2. Mikä on genomi-DNA
- Määritelmä, tosiasiat, rooli
3. Mitkä ovat cDNA: n ja genomisen DNA: n väliset yhtäläisyydet
- Yleiset ominaisuudet
4. Mikä on ero cDNA: n ja genomisen DNA: n välillä
- Avainerojen vertailu

Keskeiset termit: täydentävä DNA (cDNA), genomi, genomi-DNA (gDNA), käänteiskopiointi, RNA, transkriptooma


Mikä on cDNA

cDNA (täydentävä DNA) viittaa synteettiseen DNA: han, jonka emässekvenssit ovat komplementaarisia DNA: han. Se tuotetaan RNA-templaattien käänteisestä transkriptiosta. RNA: ta, pre-mRNA: ta, RNA: ta, ribosomaalista RNA: ta tai tRNA: ta voidaan käyttää käänteiseen transkriptioon. Käänteiskopioijaentsyymi on entsyymi, joka katalysoi reaktion cDNA: n tuottamiseksi RNA: sta. Käänteinen transkriptio, joka on kytketty PCR: ään, esitetään Kuvio 1.


Kuva 1: Käänteinen transkriptio yhdistettynä PCR: ään

cDNA: ta käytetään pääasiassa eukaryoottisten geenien kloonaamiseen prokaryoottisiin genomeihin. Eksonit koostuvat proteiinien koodaavasta alueesta. Eukaryooteissa intronit katkaisevat koodaavan alueen. Transkription aikana sekä intronit että eksonit koodataan pre-mRNA: han. Mutta mRNA-prosessoinnin aikana intronit poistetaan mRNA: sta, jolloin muodostuu kypsä mRNA: n splaissoimalla eksonit yhteen. Organisaation kokonaismRNA: ta kutsutaan transkriptomiksi. Prokaryooteilla ei kuitenkaan ole mRNA-prosessointimekanismeja. Siten mRNA: ta käytetään syntetisoimaan cDNA: ta, joka sisältää vain genomin proteiinia koodaavia alueita. Tätä cDNA: ta käytetään geenien kloonaamiseen prokaryooteihin. cDNA tuotetaan luonnollisesti retroviruksissa RNA-genomin muuntamisen aikana DNA: ksi.

Mikä on genomi-DNA

Genominen DNA (gDNA) viittaa kromosomaalisen DNA: n kokonaisryhmään genomissa. Tietyn organismin geenien kokonaisjoukkoa kutsutaan sen genomiksi. Genomin geenit eivät kuitenkaan ole aktiivisia. Useimmilla organismiryhmillä on samanlaiset genomisen DNA: n ryhmät. Organismin genomi siirretään seuraavan sukupolven toiselle. Yleensä genomit koostuvat suuresta määrästä peruspareja. Esimerkiksi ihmisen genomi koostuu noin 3 miljardista emäsparista. Ihmisen genomin kromosomit esitetään kuvio 2.


Kuvio 2: Ihmisen genomin kromosomit

Genomisessa DNA: ssa esiintyvät neljä sekvenssityyppiä ovat proteiinia koodaavia geenejä, tandemisesti toistuvia geenejä, toistuvaa DNA: ta ja spacer-DNA: ta. Genomista DNA: ta käytetään monissa molekyylibiologian kokeissa. Genomisen DNA: n eristäminen on helppoa verrattuna cDNA: n valmistukseen. Genomista DNA: ta voidaan käyttää PCR-templaateina, kloonauksessa, sekvensoinnissa, genomien kirjastojen valmistamisessa, DNA-sormenjälkitunnistuksessa, geenirakenteiden tutkimisessa ja mutaatioiden / poikkeavuuksien havaitsemisessa.

CDNA: n ja genomisen DNA: n väliset yhtäläisyydet

  • cDNA ja genomi-DNA ovat kahden tyyppisiä DNA-molekyylejä, joita käytetään molekyylibiologian tutkimuskokeissa.
  • Sekä cDNA että genominen DNA koostuvat DNA-nukleotideista.
  • Sekä cDNA että genominen DNA koostuvat sokerifosfaatin rungosta.
  • Sekä cDNA että genominen DNA ovat kaksisäikeisiä molekyylejä.
  • Sekä cDNA että genominen DNA koostuvat eksoneista.

CDNA: n ja genomisen DNA: n välinen ero

Määritelmä

cDNA-: cDNA on synteettinen DNA, jonka emässekvenssit ovat komplementaarisia genomiselle DNA: lle.

Genominen DNA: Genominen DNA on kromosomaalisen DNA: n kokonaismäärä genomissa.

edustaa

cDNA-: cDNA edustaa transkriptiota.

Genominen DNA: DNA edustaa genomia.

Syntetisoitu / uutettu

cDNA-: cDNA syntetisoidaan erilaisten RNA-tyyppien käänteisestä transkriptiosta.

Genominen DNA: Genominen DNA voidaan uuttaa olemassa olevista genomeista.

pitoisuus

cDNA-: cDNA koostuu eksoneista tai koodaavista alueista.

Genominen DNA: Genominen DNA koostuu organismin koodaavista ja ei-koodaavista sekvensseistä.

Määrä

cDNA-: cDNA sisältää muutaman emäsparin.

Genominen DNA: Genominen DNA sisältää suuren määrän emäsparia.

Käyttää

cDNA-: cDNA: ta käytetään cDNA-kirjastojen tuottamiseen.

Genominen DNA: Genomista DNA: ta voidaan käyttää genomisten kirjastojen tuottamiseen.

johtopäätös

cDNA ja genomi-DNA ovat kahdenlaisia ​​DNA-molekyylejä, joita käytetään erilaisissa kokeissa molekyylibiologiassa. cDNA syntetisoidaan RNA: sta, ja se koostuu vain eksoneista. Siksi se edustaa organismin transkriptiota. Genominen DNA voidaan helposti uuttaa solun ytimestä. Se koostuu sekä koodaavista että ei-koodaavista alueista. Se edustaa tietyn organismin genomia. CDNA: n ja genomisen DNA: n pääasiallinen ero on kunkin DNA-molekyylin tyypissä läsnä olevan DNA: n tyyppi.

Viite:

1. "CDNA (komplementaarinen DNA)".